Die Nische eines Tieres bezieht sich auf seinen Platz in seiner ökologischen Nahrungskette, und die Nische eines Kojoten steht an der Spitze der Nahrungskette, da es nicht viele, wenn überhaupt, Raubtiere gibt. Der Kojote ist ein wildes Raubtier, das viele Tiere erbeutet, was zu einer Verringerung der Tierpopulationen kleiner Fleischfresser wie Weißwedelhirsche und Rotfüchse führt.
In einigen Gebieten der Vereinigten Staaten sind die Kojotenpopulationen so weit angewachsen, dass die Kojoten die natürlichen Populationen auf ungesunde Weise einschränken, da die Kojotenpopulationen für die Gebiete, in denen sie leben, zu groß werden. Kojoten tauchen in städtischen Gebieten auf, da sie heimlich sind, wenn es darum geht, neue Lebensmittel zu erwerben.