Der Hauptnachteil der Mikrowellenübertragung besteht darin, dass Mikrowellentürme nur dann Daten austauschen können, wenn zwischen ihnen eine klare Sichtverbindung ohne Hindernisse wie Gebäude, Hügel oder Bäume besteht. Andere Nachteile umfassen Signalabsorption durch die Atmosphäre, Wetterstörungen und Kosten.
Mikrowellensignale laufen normalerweise geradlinig von einem Sender zu einem Empfänger. Durchqueren die Signale Luftbereiche mit unterschiedlicher Dichte, wie dies beim Durchqueren eines Gewässers der Fall sein könnte, verbiegen sich die Signale leicht. Anstatt den Empfänger zu erreichen, werden einige Signale in die Atmosphäre absorbiert und die verlorenen Signale beeinträchtigen die Übertragungsqualität. Mikrowellensignale können auch durch starken Regen, Hagel und Schnee beeinträchtigt werden. Vor allem Regentropfen und Hagelkörner haben etwa die gleiche Größe wie die Wellenlängen einer hochfrequenten Mikrowelle. Ein Sturm kann die Mikrowellenkommunikation blockieren und ein Problem verursachen, das als Regenfade bezeichnet wird. Ein weiterer Nachteil der Mikrowellenübertragung sind die Kosten für die Türme, deren Bau teuer ist.
Ein Vorteil der Mikrowellenübertragung besteht darin, dass anstelle von Kabeln oder anderen physischen Drähten elektromagnetische Wellen mit kleinen Wellenlängen verwendet werden. Die Größe der Wellenlängen ermöglicht es einem Sender, Mikrowellen in einem schmalen Strahl auf einen Empfänger zu richten, wodurch die Effizienz verbessert wird. Darüber hinaus bedeutet die hohe Frequenz von Mikrowellen, dass ein Mikrowellenstrahl eine sehr große Informationsübertragungskapazität hat.