Der letzte Elektronenakzeptor bei der aeroben Atmung ist laut McGraw Hill Education Sauerstoff. Ein anderes Molekül als Sauerstoff ist der letzte Elektronenakzeptor bei der anaeroben Atmung, Pyruvat. Beide Prozesse laufen während des Zellstoffwechsels ab.
Chemotrophe Mikroorganismen unterscheiden sich hinsichtlich ihrer Elektronenakzeptoren und ihrer Energiequellen. Fermentation tritt auf, wenn eine organische Energiequelle abgebaut und ohne Verwendung eines exogenen Elektronenakzeptors oxidiert wird; Wenn die Energiequelle in Abwesenheit dieses elektronischen Akzeptors abgebaut und oxidiert wird, wird der Vorgang als Atmung bezeichnet. Die Atmung kann je nach endgültigem Elektronenakzeptor aerob oder anaerob sein.