Das Ausscheidungssystem eines Wurms ist anders, da es in fast jedem Segment seines Körpers Ausscheidungsorgane hat. Das System besteht aus gewundenen Röhren, die als Nephridien bezeichnet werden und in die Körperhöhle münden.
Jedes Segment wird in eine Hauptröhre, das sogenannte Nephridiostom, gespeist, das dann die Abfallstoffe aus dem Körper transportiert, sobald alle nützlichen Nährstoffe aus den Flüssigkeiten entfernt und bis zum Ende durch den Körper geleitet wurden. Das Ausscheidungssystem hat eine doppelte Aufgabe, Abfall zu beseitigen und als Niere zu fungieren. Die Kanäle, die einen anderen Teil des Systems bilden, scheiden eine salzartige Lösung aus, um den Salzhaushalt des Körpers der Würmer aufrechtzuerhalten.