Francisco Pizarro entdeckte und eroberte das Inkareich im späteren Peru. Als er die erste spanische Siedlung in Peru, San Miguel de Piura, gründete, akzeptierte der Inkaführer Atahualpa nicht die Anwesenheit der Spanier. Infolgedessen brach die Schlacht von Cajamarca aus und Pizarro nahm Atahualpa gefangen und führte ihn schließlich hin. Angesichts dieses Führungsvakuums war es für Pizarro einfach, Cuzco, die Hauptstadt der Inka, einzunehmen und ganz Peru für Spanien einzunehmen.
Die Eroberung Perus durch Pizarro und die Eroberung Mexikos durch Cortes fanden ungefähr zur gleichen Zeit statt. Pizarros Leistung wurde als bedeutender angesehen, weil er weniger Kämpfer mitbrachte, größere Armeen aufnahm und weiter von den spanischen Nachschubposten entfernt war, die wertvolle Vorräte, Waffen und Männer für die Kampfanstrengungen lieferten. Pizarro wurde vom Sohn seines ehemaligen Freundes Diego Almagro ermordet, den Pizarro nach einer Reihe von Streitigkeiten und der blutigen Schlacht von Las Salinas hingerichtet hatte. Nach seinem Tod errichtete seine Familie ihm zu Ehren auf der Plaza Major in Truillo einen Palast. Auch heute noch ist er in Peru ein umstrittenes Thema, da viele ihn als Ursache für die Zerstörung eines Großteils der indigenen Sprache, Kultur und Religion im Land betrachten.