Bestimmte Organismengruppen, die als Pilzfresser bekannt sind, ernähren sich fast ausschließlich von Pilzen, während andere Gruppen, die als Allesfresser bekannt sind, sie zusätzlich zu anderen Nahrungsarten aufnehmen. Viele verschiedene Tierarten, darunter Säugetiere, Weichtiere, Insekten und Vögel, ernähren sich von Pilzen.
Rund 22 verschiedene allesfressende Primaten fressen Pilze, darunter Gorillas, Bonobos und Lemuren. Der Mensch verzehrt bestimmte Arten von Pilzen, wie zum Beispiel Pilze, als Teil seiner Ernährung. Nördliche Flughörnchen sind eines der wenigen Säugetiere, die sich fast ausschließlich von verschiedenen Pilzarten ernähren. Schnecken können eine Vielzahl von Pilzen verzehren, darunter viele Arten, die für andere Tiere als giftig gelten würden. Einige Nacktschnecken und Schnecken fressen einen Pilz nur in einem bestimmten Entwicklungsstadium, während andere Pilze in allen Entwicklungsstadien fressen.
Insekten wie Ameisen, Schildfliegen und Trauermücken fressen auch bestimmte Pilzarten. Mehrere hundert Ameisenarten; einige Käferarten, wie der Ambrosia-Käfer; und rund 330 Termitenarten sind ausschließlich Pilzfresser. Ambrosia-Käfer ernähren sich wie Meeresschnecken sowohl von Pilzen als auch von ihnen. Schließlich sind viele Vogelarten wie Eichelhäher und Lerchen auf Pilze als primäre Nahrungsquelle angewiesen, insbesondere in den frühen Wintermonaten.