Eine Vakuole enthält einen mit Flüssigkeit gefüllten Sack, der Salze, Wasser, Mineralien, Nährstoffe, Pigmente und Proteine innerhalb einer Membranbarriere speichert, die als Tonoplast bezeichnet wird. Vakuolen können auch Abfallprodukte enthalten, die eine Pflanze für Tiere bitter schmecken lassen.
Vakuolen verwenden Wasser, um hydrostatischen Druck zu entwickeln, der dazu beiträgt, die Pflanze steif zu halten. Sie speichern Nährstoff- und Nicht-Nährstoffchemikalien und bauen komplexe Moleküle ab. Wasser kann ungehindert in die Vakuolen ein- und austreten, aber andere kleine Moleküle werden darin gespeichert. Vakuolen bauen Abfallprodukte ab und schützen den Rest der Pflanzenzelle vor Kontamination. Speicherzellen in Samen können Proteine, Fette und Kohlenhydrate in ihren Vakuolen über viele Jahre bis zur Keimung speichern. Eine einzelne Pflanzenzelle kann mehr als eine Art von Vakuolen enthalten.
Vakuolen in Pflanzenzellen sind viel größer als in Tierzellen. Eine sehr große Vakuole zeigt normalerweise an, dass die Pflanzenzelle nicht mehr wächst. Die Umgebung in einer Vakuole ist leicht sauer, während der Rest der Pflanzenzelle leicht alkalisch ist. Wenn eine Vakuole in einer Pflanzenzelle das gesamte Wasser enthält, das sie benötigt, steht die Pflanze in einem geschwollenen Zustand auf. Eine welke Pflanze behält aufgrund der Zellwände den größten Teil ihrer Form, obwohl ihre Vakuolen schrumpfen. Wenn die Pflanze wieder Wasser bekommt, füllen sich die Vakuolen und die Pflanze nimmt ihre Form wieder an.