Jaguare sind vom Aussterben bedroht, da ihre natürlichen Lebensräume durch menschliche Eingriffe ständig verschwinden. Die Zahl der Jaguare nimmt jedoch ab, auch weil Viehzüchter sie als Bedrohung für ihr Vieh töten und Wilderer jagen sie für Pelz. Obwohl die meisten Länder mit natürlichen Jaguar-Lebensräumen, die von den Vereinigten Staaten bis Argentinien reichen, die Jaguarjagd verbieten, nimmt ihre Zahl weiter ab.
Der Hauptgrund für den Rückgang der weltweiten Jaguarpopulation ist der Verlust von Lebensräumen. Die meisten Jaguare leben im dichten Regenwald des Amazonas-Dschungels, aber der Wald verschwindet schnell, weil er für menschliche Besiedlung gerodet wird. Die Menschen fällen die Bäume für Viehzucht, Kautschukplantagen, Kakaoanbau und den Bau von Wohnhäusern. Als Reservate beiseite gelegte Dschungelfragmente bieten Jaguaren oft nicht genügend Platz zum Gedeihen. Wenn ihre natürliche Beute verschwindet, jagen Jaguare Rinder und anderes Vieh. Als Vergeltung stellen viele Viehhalter Vollzeitjäger ein, die Jaguare auf Sicht schießen. Darüber hinaus sind ihre Felle trotz internationaler Jagd-, Import- und Verkaufsverbote immer noch gefragt.
Seit den 1960er Jahren wurden erhebliche Anstrengungen zur Erhaltung des Jaguars unternommen. 1973 wurde der Verkauf von Pelzen durch das Übereinkommen über den internationalen Handel mit gefährdeten Arten stark eingeschränkt. Zu den Bemühungen, den menschlichen Eingriff in Jaguar-Lebensräume zu reduzieren, gehören die Schaffung neuer Schutzgebiete, Ökotourismus und die Ausbildung von Viehzüchtern. Solche Maßnahmen waren jedoch wirkungslos, um den stetigen Rückgang der Zahl der Arten einzudämmen.
