Hefekolonien sind größer als Bakterienkolonien, da einzelne Hefezellen erheblich größer sind als Bakterienzellen. Sowohl Hefen als auch Bakterien sind einzellige Mikroorganismen, aber Hefen sind Eukaryoten und Bakterien sind Prokaryoten. Eine eukaryotische Zelle enthält einen Kern und strukturelle Organellen, die von einer Doppelmembran eingeschlossen sind. Hefen haben auch dicke Zellwände, die den Organismus einkapseln. Prokaryonten, wie Bakterien, sind kleiner, weil ihnen ein Zellkern und membrangebundene Organellen fehlen.
Hefezellen nehmen durch Knospung asexuell zu. Wie von Gary Kaiser vom Community College of Baltimore County erklärt, bildet sich auf der äußeren Oberfläche einer Elternzelle eine Knospe und der Zellkern teilt sich. Einer der geteilten Kerne dringt in die sich bildende Knospe ein, und zwischen der Elternzelle und der Knospe wird Zellwandmaterial produziert. Die Knospe bricht ab und wird zu einer neuen Tochterzelle. Diese Vermehrung genetisch identischer Hefezellen besiedelt eine Kolonie. Bakterien teilen und besiedeln Kolonien durch binäre Spaltung, eine andere Form der asexuellen Fortpflanzung. Die zirkuläre DNA des Bakteriums repliziert und die Kopien werden an gegenüberliegenden Enden der Zelle getrennt. Die Zellwand des Bakteriums wächst, während sich im Zentrum der Zelle eine Spalte bildet. Die Spalte quetscht schließlich die sich teilende Zelle in zwei separate, aber identische Tochterzellen. Die binäre Spaltung setzt sich in jeder Tochterzelle fort und bevölkert die Bakterienkolonie.
