Da es sich um Hybriden mit einer ungeraden Chromosomenzahl handelt, können Maultiere, die durch die Zucht von Pferd und Esel entstehen, im Allgemeinen nicht reproduzieren. Maultiere haben 63 Chromosomen, während Pferde 64 . haben und Esel haben 62. In sehr seltenen Fällen wurden weibliche Maultiere trächtig, nachdem sie mit reinrassigen Pferden verpaart wurden.
Auch wenn Maultiere sich in fast allen Fällen nicht fortpflanzen können, produzieren sie dennoch Fortpflanzungshormone und haben den Drang zur Paarung. Aus diesem Grund werden die meisten männlichen Maultiere kastriert, um sie leichter zu handhaben und sozialer zu machen. Wallach männliche Maultiere werden manchmal als "John Maultiere" bezeichnet, während intakte männliche Maultiere oft "Hengst Maultiere" genannt werden. Weibliche Pantoletten werden oft "Molly Mules" oder "Mare Mules" genannt.
Obwohl der Begriff "Maultier" häufig verwendet wird, um sich auf alle Nachkommen einer Paarung von Pferd und Esel zu beziehen, bezieht sich der Begriff "Maultier" technisch speziell auf die Nachkommen eines weiblichen Pferdes und eines männlichen Esels. Wenn ein weiblicher Esel und ein männliches Pferd gezüchtet werden, wird der resultierende Nachwuchs als "Hinny" bezeichnet. Wie Maultiere sind Maulesel steril und haben 63 Chromosomen. Hinnies und Maultiere haben ein ähnliches Aussehen, obwohl Hinnies dazu neigen, rundere, eselähnlichere Hufe zu haben als Maultiere. Hinnies sind auch in der Regel kleiner als Maultiere, und ihre Köpfe sind eher pferdeartig, haben kürzere Ohren und raffiniertere Merkmale.
