Samen werden in den Eierstöcken einiger Pflanzenarten gebildet. Nicht alle Pflanzen haben die Fähigkeit, Samen zu produzieren. Nur die in den Divisionen Cycadophyta, Ginkgophyta, Gnetophyta, Coniferophyta und Anthophyta verwenden Samen zur Fortpflanzung. Sie werden aus der Eizelle der Mutterpflanze und dem Pollenkorn der Vaterpflanze erzeugt.
Ein Samen, der in der Samenanlage der weiblichen Pflanze gebildet wird, besteht aus mehreren Teilen. Der Embryo ist die Struktur, die später zu einer reifen Pflanze heranwächst. Es enthält einen Chromosomensatz der Mutterpflanze und einen zweiten Satz des Vaters. Es gibt vier Hauptteile des Embryos. Das Keimblatt ist ein Samenblatt, das Nahrung speichert, das Plumule und das Hypokotyl sind der Stamm und der Spross der embryonalen Pflanze, und die Keimwurzel entwickelt sich später zur Wurzel der Pflanze. Neben dem Embryo enthält der Samen Endosperm, das zwei Chromosomensätze von der Mutter und einen vom Vater enthält. Das Endosperm bietet der Pflanze eine Nahrungsquelle, während es zu einer winzigen Pflanze keimt. Sowohl der Embryo als auch das Endosperm sind in einer Samenhülle eingekapselt, die sich aus dem Embryosack des Gewebes der Mutterpflanze entwickelt. Die Samenhülle ist eine zähe Schutzschicht, die eine Schädigung des Embryos und des Endosperms verhindert.
