Die Anzahl der Chromosomen, die ein Affe hat, hängt von der Affenart ab. Der Rhesusaffe hat 42 Chromosomen, der Kapuzineraffe 54 und der Totenkopfäffchen 44. Affen wie der Seidenbüffel haben 46 Chromosomen, was der gleichen Anzahl von Chromosomen wie der Mensch entspricht.
Alle Arten von Menschenaffen haben 48 Chromosomen, also ein Paar mehr als der Mensch. Sowohl Affen als auch Menschenaffen vermehren sich sexuell und geben ihnen eine haploide und eine diploide Zahl. Die haploide Zahl ist die Hälfte der diploiden Zahl. Es ist die Anzahl der Chromosomen in einer Geschlechtszelle oder die Anzahl der Chromosomenpaare. Die diploide Zahl ist die Anzahl der Chromosomen in einer Zelle, die keine Ei- oder Samenzelle ist.