Normale menschliche Zygoten haben alle 46 Chromosomen, die in 23 Paaren organisiert sind, die gleiche Anzahl wie die meisten erwachsenen Menschen. Zusammen enthalten diese 46 Chromosomen laut National Human Genome schätzungsweise 25.000 Gene Forschungsinstitut. Manchmal entwickeln menschliche Embryonen ein zusätzliches Chromosom, das die Entwicklung des Down-Syndroms beeinflusst.
NHGRI weist auf einen Unterschied zwischen den ersten 22 Chromosomenpaaren oder Autosomen und dem letzten Paar namens "Geschlechtschromosomen" hin. Jeder Mensch hat von der Empfängnis an einen vollständigen Satz Autosomen und trägt sie daher während der gesamten Zygotenphase der Gestikulation. Manche Menschen werden mit einem Geschlechtschromosom weniger gezeugt. Dieser als Turner-Syndrom bekannte Zustand führt immer zu einer weiblichen Zygote, da das fehlende Chromosom immer das männliche oder "Y"-Chromosom ist.
Numerische Anomalien wie diese sind jedoch bei den meisten sich entwickelnden Zygoten nicht vorhanden, und die Mehrheit der Menschen trägt das normale Komplement von 46. Interessanterweise ist diese Zahl zwei weniger als das Komplement, das von den meisten Affen getragen wird. Das Office of Science des Department of Energy beschreibt die Art und Weise, wie das menschliche Chromosom Nummer 2 angeordnet zu sein scheint, als ob es aus der Verschmelzung eines angestammten Chromosomenpaares resultierte, was es als die sparsamste Erklärung für den Unterschied in der Chromosomenzahl zwischen Menschen identifiziert und Affen.
