National Geographic spekuliert, dass der Mt. Fuji eine große Reserve an basaltischem Magma entwickelt, basierend auf einer Zunahme von Erdbeben, die erstmals in den frühen 2000er Jahren festgestellt wurden. Die Hitze und das Gas, die von basaltischem Magma an die Oberfläche gebracht werden, verursachen diese Beben.
Die zerstörerische Kraft des Ausbruchs von 1707 hat möglicherweise die innere Struktur des Vulkans verändert, was bedeutet, dass er derzeit eine andere Art von Magma enthält als in der Vergangenheit, als der Vulkan alle 30 Jahre regelmäßig ausbrach. Die japanische Regierung befürchtet, dass die derzeitige Ruhe des Berges es ihm ermöglichen könnte, sich mit einer explosiveren Art von Magma einzudecken.