Ein Proton ist ungefähr 2.000-mal schwerer als ein Elektron. Protonen und Elektronen sind zusammen mit Neutronen die wichtigsten subatomaren Teilchen, aus denen ein Atom besteht.
Protonen und Elektronen haben gleiche, aber entgegengesetzte Ladungen. In den meisten Fällen haben Atome die gleiche Anzahl von Protonen und Elektronen. Da Protonen jedoch so viel schwerer sind als Elektronen, tragen die Elektronen nicht wesentlich zur Masse eines Atoms bei. Die Massen von Atomen werden in relativen Masseneinheiten ausgedrückt, die als atomare Masseneinheiten oder a.m.u. bezeichnet werden. Protonen haben eine Masse von 1.007277 amu, und Elektronen haben eine Masse von 0,00054858 amu.