Es gibt keine sicheren, aber effektiven Methoden, um Fledermäuse massenhaft zu töten. Wenn ein Fledermausquartier ein Problem darstellt, ist es besser und normalerweise einfacher, Netze über den Löchern zu verwenden, um sie dazu zu bringen, sie dauerhaft zu verlassen. In den meisten Gerichtsbarkeiten ist das Töten von Fledermäusen illegal, und diejenigen, die versuchen, Fledermäuse zu töten, können mit sehr hohen Geldstrafen belegt werden.
Fledermäuse fressen lebende Insekten und sind geschickt darin, sie in der Luft zu fangen, daher sind Versuche, sie dazu zu bringen, vergiftete Insekten aufzunehmen, normalerweise erfolglos. Gifte auf Aerosolbasis sind ebenso wirkungslos, da Fledermäuse das Gebiet schnell verlassen können.
Im Gegensatz zu Insekten sind Fledermäuse Säugetiere, und Gifte, die kleine Säugetiere befallen, können auch Menschen betreffen. Eine fledermaustödliche Menge DDT beispielsweise würde auch die Familie im Haus gefährden. Darüber hinaus haben Fledermäuse große Muskeln, die beim Tod zusammenbrechen und einen unangenehmen Geruch verursachen. Wenn diese Fledermäuse im Haus oder in den Wänden sterben, kann der Geruch zurückbleiben.
Das Entfernen von Fledermäusen beinhaltet normalerweise das Anbringen eines Netzes, das wie ein Windsack geformt ist, um die Löcher, durch die sie ein- und austreten. Dieses Netting ermöglicht ihnen das Verlassen, aber nicht das Betreten.
Fledermäuse sind für den Menschen im Allgemeinen harmlos und fressen viele Insekten – bis zu 8.000 pro Nacht. Fledermäuse fressen oft Mücken, die mit Malaria, Herzwürmern und West-Nil-Fieber in Verbindung gebracht werden.