Maine-Coon-Katzen leben normalerweise 12 bis 15 Jahre. Sie sind im Allgemeinen robust und gesund, unterliegen jedoch mehreren genetischen Störungen, darunter Hüftdysplasie und feline hypertrophe Kardiomyopathie.
Hüftdysplasie ist eine Anomalie der Hüfte, die Lahmheit und Arthritis verursachen kann. Feline HCM ist die häufigste Ursache von Herzerkrankungen bei Katzen und ist eine fortschreitende Erkrankung, die zu Herzversagen und plötzlichem Tod führen kann. Eine andere genetische Störung, die manchmal bei Maine Coons auftritt, ist die spinale Muskelatrophie, die Muskelschwäche und eine verkürzte Lebensdauer verursacht. Verantwortungsvolle Züchter untersuchen ihren Zuchtbestand und ihre Kätzchen auf diese Störungen.