Der Dünndarm besteht aus drei Hauptteilen: dem Zwölffingerdarm, dem Jejunum und dem Ileum. Der Zwölffingerdarm ist der erste Teil des Dünndarms, der sich direkt nach dem Magen im Darmtrakt befindet. Das Jejunum folgt dem Duodenum, und das Ileum ist der letzte Teil des Dünndarms, der sich kurz vor dem Dickdarm befindet.
Der Zwölffingerdarm oder der erste Teil des Dünndarms erhält den Inhalt des Verdauungssystems aus dem Magen durch ein enges Muskelband, das als Pylorussphinkter bekannt ist. Dieser Teil des Dünndarms ist ungefähr 10 Zoll lang und ist die Stelle, an der Verdauungsenzyme aus der Bauchspeicheldrüse und der Gallenblase in den Dünndarm entleert werden. Der Mageninhalt ist sehr sauer, wenn er in den Zwölffingerdarm gelangt. Bikarbonat aus der Bauchspeicheldrüse wird in den Zwölffingerdarm freigesetzt, um den Verdauungsinhalt zu neutralisieren und zu verhindern, dass die Säure die Zwölffingerdarmschleimhaut schädigt.
Teilweise verdaute Nahrung wird durch wellenförmige Muskelkontraktionen, die als Peristaltik bezeichnet werden, durch den Zwölffingerdarm in das Jejunum geschoben. Das Jejunum ist zwischen 3 und 6 Fuß lang und ist der Teil des Dünndarms, in dem der Großteil der chemischen Verdauung und Absorption von Nährstoffen stattfindet. Wenn es das Ende des Zwölffingerdarms erreicht, wandert die teilweise verdaute Nahrung durch ungefähr 6 - 12 Fuß des Ileums, den letzten Teil des Dünndarms, wo zusätzliche Verdauung und Absorption stattfinden. Es wird dann durch den Ileozökalsphinkter in den Dickdarm entleert.