Louis Pasteur widerlegte schließlich die spontane Bildung durch ein Experiment, bei dem Rinderbrühe durch Kochen in zwei Flaschen sterilisiert wurde, einer, der der Luft ausgesetzt war, und der andere davor geschützt. Der andere wurde Verunreinigungen trübten sich und zeigten mikrobielles Wachstum, während die versiegelte dies nicht tat.
Louis Pasteur ist berühmt für seine Beiträge zum Verständnis von Krankheiten und Mikroben im Allgemeinen. Der Prozess der Pasteurisierung, bei dem Milch, Wein und andere Verbrauchsmaterialien behandelt werden, um eine bakterielle Kontamination zu stoppen, wurde von ihm entdeckt und nach ihm benannt. Pasteur hat als erster gezeigt, dass die Fermentation durch Mikroorganismen verursacht wird und für diesen Prozess kein Sauerstoff benötigt wird.
Pasteur hat nicht die Keimtheorie erfunden, aber er war derjenige, der genügend experimentelle Beweise lieferte, um den größten Teil der wissenschaftlichen Gemeinschaft davon zu überzeugen, dass sie wahr ist. Er war auch der Erste, der die Prinzipien der Impfung erklärte, und er entwickelte die ersten Impfstoffe gegen Tollwut und Milzbrand. Er entdeckte diese Prinzipien nach einem Missgeschick, als er die Hühnercholera studierte, eine normalerweise tödliche Krankheit. Er behandelte die Hühner mit einer verdorbenen Bakterienkultur, die nur leichte Symptome hervorrief. Danach konnte er die Hühner nicht einmal mit lebensfähigen Bakterien erneut infizieren.