Ein Beispiel für eine parasitäre Beziehung in Korallenriffen sind Krebstiere der Copepoda- oder Isopoda-Orden, die sich an Fischen in den Riffen anheften und manchmal Schaden anrichten, aber manchmal einfach an vorbeischwimmenden Nahrungspartikeln festhalten und sich davon ernähren sie. Korallenriffe beherbergen Organismen, die in einer Reihe verschiedener Beziehungen koexistieren, einschließlich Parasitismus, aber auch Symbiose, Konkurrenz, Kommensalismus und Mutualismus.
Während einige Parasiten ihren Wirten nicht schaden, tun es andere. Ektoparasiten bleiben an ihre Wirte gebunden und nehmen ihnen wichtige Nahrungsgrundlagen; Dies ist jedoch bei weitem nicht die einzige Verbindung zwischen Organismen in einer Korallenriffumgebung.
Mutualismus bezieht sich auf eine Symbiose, von der beide Arten profitieren. Ein Beispiel ist die Verwandtschaft zwischen der Boxerkrabbe und einigen Anemonenarten. Die Krabbe greift die Anemone mit ihren Krallen, damit die stechenden Tentakel der Anemone Raubtiere in Schach halten; die Anemone profitiert davon, indem sie die Reste der Krabben isst.
Kommensalismus bezieht sich auf eine Symbiose, bei der eine Art eine andere schützt, wie beispielsweise die Verbindung zwischen Anemonen und Clownfischen. Die Clownfische leben in den Tentakeln der Anemonen, die mit Schleim bedeckt sind, damit die Stiche der Anemonen sie nicht beeinträchtigen. Andere Tiere wie Garnelen und Krabben suchen Schutz in Anemonen, ohne die relative Sicherheit der Tentakel verlassen zu müssen.
Wettbewerb bezieht sich auf einen Zustand, in dem Arten um Ressourcen kämpfen. Wenn die Bevölkerung steigt, nimmt auch der Wettbewerb zu, was zu einer Korrektur der Bevölkerung führt, da jüngere Erwachsene sterben und sich die Fortpflanzung verlangsamt.