Jedes Salz- oder Brackwasser, das eine flache Trennung vom Rest des Meeres bildet, wird als Lagune betrachtet und bildet sich, wenn sich Sandbänke oder Riffe entlang flacher Gewässer in Küstennähe bilden oder wenn Korallenriffe wachsen auf zentralen Inseln, die sinken. Flussmündungen oder Süßwasserbäche ernähren die Lagunen, während sie wachsen.
Das Wort "Lagune" stammt aus dem Jahr 1769. Seine erste Verwendung bezieht sich auf den mit Inseln übersäten Salzwasserstreifen am Rande von Venedig, der von den Barrierestränden des Lido vor den stürmischen Wellen der Adria geschützt wird. Das italienische Wort "laguna", das auf dem lateinischen Wort "lacuna" oder leerer Raum basiert, war die Inspiration für diesen englischen Begriff. Einige Lagunen haben andere Namen angenommen, wie die Albemarle Sounds in North Carolina oder der Banana River in Florida, aber sie sind immer noch Lagunen.
Wenn sich eine Lagune als Teil des Ökosystems eines Korallenriffs bildet, bedeutet der Begriff dasselbe wie "Rückenriff", der von Wissenschaftlern verwendete Fachbegriff. Ob die Lagune Teil eines Korallensystems ist oder nicht, ihr flaches Wasser macht sie extrem empfindlich gegenüber Veränderungen in der Umgebung.