Prokaryotischen Zellen fehlt ein Zellkern. Bakterien und Mitglieder der Domäne Archaea sind Prokaryoten, während Pflanzen, Tiere, Protisten und Pilze Eukaryoten sind. Prokaryontischen Zellen fehlen die membrangebundenen Organellen, die in eukaryontischen Zellen vorkommen.
Prokaryontische Zellen sind viel kleiner und viel einfacher als eukaryontische Zellen.
Die beiden Zelltypen weisen jedoch einige Ähnlichkeiten auf. Prokaryontische Zellen und eukaryontische Zellen enthalten beide Zytoplasma und haben Ribosomen zur Produktion von Proteinen. Beide Zelltypen enthalten auch DNA, aber die DNA in prokaryotischen Zellen ist zirkulär, während die DNA in eukaryotischen Zellen linear ist.
Bakterien sind ein häufiges Beispiel für eine prokaryontische Zelle.