Eukaryotische Zellen verfügen alle über einen Zellkern und ihre Organellen sind von Membranen umgeben. Sie haben auch eine Plasmamembran, eine Schicht aus Phospholipiden, die die gesamte Zelle umgibt, und sie verfügen über ein inneres Zytoskelett .
Im Vergleich zu prokaryontischen Zellen sind eukaryontische Zellen mindestens 10-mal größer. Ihr Zytoplasma besteht sowohl aus Ribosomen als auch aus Cystol. Geschützt durch ihre Plasmamembran verfügen sie auch über einen Schutz für jede Organelle in Form einzelner Membranen. Die Plasmamembran ist der Ort für Signal- und Transportfunktionen für die gesamte Zelle.
In eukaryontischen Zellen ist das Endomembransystem ein Netzwerk von Membranen, die Materialien teilen. Die Lysosomen, das endoplasmatische Retikulum und der Golgi-Apparat sind alle Teil dieses größeren Systems. Eukaryotische Zellen haben auch eine extrazelluläre Matrix, die aus Glykoproteinen und Proteinen besteht, die andere Zellen sezerniert haben. Diese Matrix sitzt um viele verschiedene Tierzellen herum.
Eukaryontische Zellen bewegen sich je nach Art des Eukaryonten durch die Funktion von Flagellen oder Zilien. Flagellen sind Schwänze an einem Ende der Zelle, die hin und her peitschen und die Zelle in eine Richtung treiben. Zilien sind kürzer und zahlreicher, und sie alle schlagen gemeinsam, um die Zelle in eine bestimmte Richtung zu treiben.