Der überzeugendste Vorteil eines Unternehmenssystems besteht darin, dass es die Zusammenarbeit und Effizienz zwischen den Abteilungen einer Organisation ermöglicht. Die häufig erforderlichen erheblichen Investitionen in Infrastruktur und organisatorische Prozesse sowie die Belastung durch strategische Planung und organisationsübergreifende Teamarbeit stellen eine Herausforderung dar.
Im Erfolgsfall bietet die Implementierung eines Enterprise-Systems das Potenzial für große Wettbewerbsvorteile. Durch eine effizientere Ressourcennutzung, ein besseres Gesamtmanagement der Kundenbeziehungen und eine verbesserte betriebliche Effizienz können Unternehmen Konkurrenten übertreffen. Einige Unternehmen haben ein System, das beispielsweise Verkaufsprognosen mit Produktionsbudgets und Materialbeständen verbindet.
Unternehmenssysteme werden von Softwareplattformen angetrieben. Der Aufbau einer optimalen Infrastruktur inklusive der passenden Softwarelösung ist für viele Unternehmen eine große Investition. Von Anfang an das richtige System einzuführen, ist ein Anliegen. Manche Unternehmen nehmen sich nicht von Anfang an die Zeit, strategisch zu planen, was das Risiko einer Fehlinvestition erhöht. Andere bekommen entweder nicht genügend Abteilungsleiter in die strategische Planung ein, oder sie entwickeln eine fehlgeschlagene Strategie. Selbst mit einer sorgfältigen Strategie ist die Implementierung eines Systems, das die Technologie an der Einbeziehung aller Mitarbeiter im gesamten Unternehmen ausrichtet, ein Hindernis. Eine Kultur der Zusammenarbeit erhöht die Erfolgschancen, aber auch klare Kommunikation und Arbeitsabläufe sind notwendig.