Die Schildkröte ist eines der wenigen Tiere, die sowohl ein inneres als auch ein äußeres Skelett haben. Das Endoskelett besteht aus Knochen, die denen anderer Säugetiere ähnlich sind, während das Exoskelett im Tierreich einzigartig ist. Ein auffallender Unterschied besteht darin, dass sich die Schultergürtel von Schildkröten in ihren Brustkorb befinden.
Die Panzer der meisten Schildkröten werden durch die Verschmelzung von Skelettknochen und Hautknochen gebildet, die aus der Haut heraus entstehen. Bei den meisten Arten verschmilzt die Wirbelsäule mit der Schale. Eine Ausnahme ist die größte Art der Welt, die Lederschildkröte. Die Wirbelsäule des Lederrückens bleibt ungebunden, da diese Schildkröte keinen harten Panzer hat. Stattdessen hat sein Rücken eine ledrige Haut, die zahlreiche winzige Knochen enthält. Diese Anpassung ermöglicht es der Lederschildkröte, sicher bis in eine Tiefe von 3.000 Fuß zu tauchen.
Wissenschaftler kategorisieren die Abschnitte des Endoskeletts der Schildkröte in ein axiales Skelett, das aus Wirbelsäule und Schädel besteht, und ein Blinddarmskelett, das aus Becken- und Brustgürtel sowie Humerus, Radius, Elle und Handwurzeln besteht , Oberschenkelknochen, Mittelhandknochen, Tibia, Fußwurzeln, Mittelfußknochen, Phalangen und Wadenbeine.
Im Gegensatz zu Amphibien mit Skeletten, die große Mengen an Knorpel enthalten, bestehen Schildkrötenskelette hauptsächlich aus Knochen. Einige Schildkrötenknochen enthalten Mark, das sowohl rote als auch weiße Blutkörperchen produziert.
