Der Hauptunterschied zwischen Photosystem I und Photosystem II ist der Absorptionspeak. Laut HyperPhysics von der Georgia State University hat Photosystem I einen Absorptionspeak von 700 Nanometern, während Photosystem II einen Absorptionspeak von . hat 680 Nanometer.
Photosystem I und II sind wichtige Teile des Photosyntheseprozesses, da sie die beiden großen Proteine oder photosynthetischen Reaktionszentren sind, die für das Einfangen der einzelnen Lichtphotonen verantwortlich sind, die zur Herstellung von Zucker verwendet werden. Photosystem I ist ein Komplex aus einem Dutzend Proteinen, der über 100 Cofaktoren unterstützt und positioniert. Es verwendet Antennenkomplexe, bei denen es sich um lichtsammelnde Pigmente wie Chlorophyll und Beta-Carotin handelt, um das Pigment zu absorbieren, das die Chlorophyll-a-Moleküle im Reaktionszentrum umgibt. Die Pigmente absorbieren die Photonen und übertragen die Energie von Molekül zu Molekül, bis es das Reaktionszentrum von Photosystem I erreicht. Sobald es das Reaktionszentrum erreicht, wird die Energie verwendet, um ein Elektron auf einen Elektronenakzeptor zu übertragen, der später zum Antrieb des Calvin . verwendet wird Zyklus.
Photosystem II hat ein viel kleineres Bindungsprotein als Photosystem I, das ein Molekulargewicht von 110.000 hat. Das Photosystem II hat laut HyperPhysics nur ein Molekulargewicht von etwa 47.000. Darüber hinaus enthält Photosystem II Chlorophyll a- und b-Moleküle sowie Xanthophylle, enthält jedoch keine Beta-Carotin-Pigmente wie Photosystem I. Während Photosystem I Energie für den Calvin-Zyklus sammelt, sammelt Photosystem II Energie für die ersten Stufen des nichtzyklischen Elektrons Transportzyklus.