Zu den natürlichen Ressourcen von Missouri gehören Blei, Zink, Eisenerz, Dolomit, Schwerspat, Kalkstein, Kupfer, Granit, Marmor, Sandstein, Boden für landwirtschaftliche Aktivitäten sowie zahlreiche Seen und Flüsse. Missouri produziert 90 % des nicht recycelten Bleis in den USA, Stand August 2014. Zu den landwirtschaftlichen Produkten zählen Sojabohnen, Mais, Heu, Rinder, Puten und Hühner.
Missouri verfügt über mehr als 300 Minen, die für 8 Milliarden US-Dollar an Wirtschaftstätigkeit verantwortlich sind (Stand August 2014). In den Minen von Missouri sind mehr als 30.000 Menschen beschäftigt. Missouri ist der Staat mit der höchsten Bleiproduktion, und 80 Prozent des in Missouri geförderten Bleis werden in Autobatterien verwendet. Missouri ist auch der größte Produzent von Kalk in den Vereinigten Staaten, von dem der größte Teil in die Zementproduktion fließt. Der Show-Me-Staat liegt an dritter Stelle bei Zink, an fünfter Stelle bei Kupfer und an sechster Stelle beim Silberbergbau aller 50 Bundesstaaten.
Die Wasserstraßen von Missouri umfassen Flüsse wie Missouri, Mississippi, Platte, Osage, Meramec, Gasconade, St. Francis und Current. Zu den größten Seen des Staates, die alle künstlich sind, gehören Lake of the Ozarks, Table Rock, Stockton und Bull Shoals.
Zu den wichtigsten Fischarten in den Seen und Flüssen des Staates zählen Wels, Forelle, Barsch, Crappie, Zander und Barsch. Die kleinste Fischart in Missouri ist mit 1,5 Zoll die kleinste Fischart, und die größte ist der riesige Paddelfisch mit mehr als 100 Pfund.
