Beispiele für Archaebakterien sind Halophile, Methanogene und Thermophile. Arcahebakterien sind einzellige Organismen, die zur Domäne Archaea gehören. Allen gemeinsam ist die Fähigkeit, unter extremen Umweltbedingungen zu gedeihen, die vor mehreren Milliarden Jahren existierten.
Die Halophile werden unter Bedingungen mit hohem Salzgehalt gefunden. Dazu gehören Seen und Meerwasser. Die Methanogene produzieren Methan und kommen im Darm von Wiederkäuern sowie in Mooren und Kläranlagen vor. Thermophile werden in Umgebungen mit intensiver Hitze gefunden, wie in Quellen und in der Nähe von hydrothermalen Quellen. Archaebakterien ähneln Eubakterien darin, dass ihnen ein Zellkern fehlt.