Sowohl Bakterien als auch Archaeen sind Organismen, die aus einer einzelnen Zelle bestehen, der kein Zellkern oder Organellen fehlen. Obwohl diese beiden Gruppen evolutionär einzigartig sind, gibt es eine Reihe von Ähnlichkeiten. Es ist leicht zu verstehen, warum Archaeen einst als eine Art von Bakterien angesehen wurden.
Alle lebenden Organismen gehören zu einer von drei Gruppen oder Domänen. Diese Domänen sind Archaea, Bakterien und Eukaryota. Eukaryotische Organismen haben Zellen, die einen Kern und andere Organellen enthalten, die durch einzelne Membranen gebunden sind. Tiere, Pflanzen und Pilze sind allesamt Eukaryoten. Archaeen und Bakterien sind prokaryontische Zellen – sie enthalten keine membrangebundenen Organellen. Beide Gruppen enthalten jedoch Ribosomen. Ribosomen bestehen aus RNA und Proteinen und bilden alle für das Überleben einer Zelle notwendigen Proteine. Bakterien und Archaeen sind beide bewegungsfähig und erreichen dies über Geißeln. Beide Arten von Organismen sind auch beide von einer Zellwand umgeben. Die beiden prokaryontischen Domänen vermehren sich durch asexuelle Fortpflanzung. Beiden Domänen sind drei Methoden gemeinsam: Binärspaltung, Fragmentierung und Knospung. Bei der binären Spaltung verdoppeln die Zellen ihre Größe und teilen sich dann gleichmäßig auf, wodurch gleich große Tochterzellen entstehen. Bei der Fragmentierung wächst eine neue Zelle aus einem abgetrennten Stück der Elternzelle. Bei der Knospung entwickelt sich aus dem Elternorganismus irgendwann ein neuer Organismus. Aufgrund der ungeschlechtlichen Fortpflanzung sind die Nachkommen von Archaeen und Bakterien genetische Kopien der Eltern.
