Die Organelle, die die Zellfunktionen in einer eukaryotischen Zelle verwaltet, ist der Zellkern. Die meisten eukaryotischen Zellen haben einen einzigen Zellkern; Einige Organismen können jedoch mehrere Kerne pro Zelle haben.
Der Zellkern ist im Allgemeinen kugelförmig. Die Kernhülle schützt den Kern und lässt nur bestimmte Substanzen zwischen ihm und dem Zytoplasma passieren. Innerhalb des Zellkerns existiert der Nukleolus, eine kugelförmige Struktur, die eine gewisse Rolle bei der Alterung von Zellen spielt.
Die Funktion dieser zentralen Organelle ist der des Gehirns analog; es nimmt Informationen aus dem Rest der Zelle auf und koordiniert die verschiedenen Zellaktivitäten, vom Zellwachstum bis zur Herstellung von Proteinen. Der Zellkern enthält auch das Erbmaterial, die DNA, der Zelle.