Micrococcus luteus ist ein kugelförmiges Bakterium mit einer Länge zwischen 0,5 und 3,5 Millimeter, das in aeroben Umgebungen wächst und auf Agarplatten gelbe Kolonien bildet. Micrococcus luteus ist typischerweise Gram-positiv, kann aber je nach Stamm manchmal gramvariabel sein. Gram-positiv bedeutet, dass sich die Bakterien bei Behandlung mit Gram-Färbung violett verfärben. Dies ist auf Unterschiede in der Zellwand im Vergleich zu gramnegativen Bakterien zurückzuführen.
Micrococcus luteus wird allgemein als nicht-pathogen beschrieben, was bedeutet, dass es bei Menschen keine Krankheiten verursacht, es sei denn, ihr Immunsystem ist bereits geschwächt. Kolonien von Micrococcus luteus wachsen typischerweise auf der Haut von Säugetieren und werden häufig im oder auf dem Mund und den Atemwegen des Menschen gefunden. Diese Bakterien können auch im Boden und im Wasser wachsen, solange genügend Sauerstoff vorhanden ist.
Micrococcus luteus zeichnet sich durch seine relativ kleine Genomgröße aus, insbesondere im Vergleich zu anderen freilebenden Bakterien. Sein Genom ist nur 2,5 Millionen Basenpaare groß. Kleinere Genome treten in der Regel bei Parasiten auf, nachdem die Gene für Stoffwechselprozesse, die der Parasit von seinem Wirt erhält, verloren gegangen sind. Da Micrococcus luteus jedoch genauso gut im Boden leben kann wie in größeren Organismen, ist er kein Parasit und hat lediglich ein kleines Genom.