Eine 99-Minuten-CD-R mit 4,7 Zoll (12 cm) kann bis zu 999,3 Megabyte an Daten aufnehmen. Die 99-Minuten-Rohlinge für CD-Rs sind jedoch nicht so beliebt als 74-Minuten, 670-MB-Standard-Disc aufgrund von Aufnahme- und Leseproblemen, die mit ersterem verbunden sind.
Obwohl verschiedene CD-Rs mit einer angegebenen maximalen Datenspeicherkapazität vermarktet werden, kann man normalerweise mehr Daten auf die Disc schreiben oder "überbrennen" über die angegebene Kapazität hinaus. Dies liegt daran, dass die Datenspeicherkapazität von CD-Rs anhand der Red Book-Standard-Audiodaten gemessen wird, die eine Zuteilung von 90 Sekunden digitaler Stille vorsehen.
Der stille oder leere Bereich wird als "Lead-Out" bezeichnet und ist in den meisten CD-Rs zusammen mit anderen Standardbereichen wie dem Lead-In und dem Programmbereich enthalten. Derselbe leere Bereich kann verwendet werden, um in einem CD-Brennvorgang zusätzliche Daten auf die Disc zu schreiben.
Multi-Session-Discs hingegen verlieren mit jedem Brennvorgang verfügbaren Datenspeicherplatz. Bei der ersten Brennsitzung gehen ungefähr 23 Megabyte an Daten verloren. Nachfolgende Datenbrennsitzungen führen zu einem Verlust von 14 MB Speicherplatz pro Sitzung.
Einige CD-R-Laufwerke verwenden auch spezielle Techniken, um mehr Daten auf die CD-R zu schreiben. Die auf die CD-R geschriebenen Daten sind jedoch möglicherweise nicht kompatibel und in anderen Standard-CD-R-Playern nicht lesbar.