Enzyme werden in sechs Typen eingeteilt: Oxidoreduktasen, Transferasen, Hydrolasen, Lyasen, Isomerasen und Ligasen. Die Enzymklassifizierung basiert auf der chemischen Reaktion, die das Enzym katalysiert.
Enzyme, die als Oxidoreduktasen klassifiziert werden, führen Oxidations- und Reduktionsreaktionen durch, wobei ein Substrat oxidiert und ein anderes reduziert wird. Transferasen verschieben funktionelle Gruppen von einem Molekül zum anderen. Hydrolasen brechen Einfachbindungen zwischen Atomen, indem sie ein Wassermolekül hinzufügen. Lyasen übertragen Aminogruppen, Wasser oder Ammoniak, um eine Doppelbindung innerhalb eines Moleküls zu bilden oder zu entfernen. Isomerasen verändern die Position funktioneller Gruppen, sodass Substrat und Produkt Isomere voneinander sind, also die gleiche Anzahl von Atomen enthalten. Schließlich katalysieren Ligasen chemische Reaktionen durch die Entfernung eines Wassermoleküls, um Einfachbindungen zu bilden.