Das raue endoplasmatische Retikulum (ER) erfüllt mehrere entscheidende Funktionen, wie die Herstellung lysosomaler Enzyme, die Herstellung von sezernierten Proteinen, die Integration von Proteinen in die Zellmembran und die Erleichterung der Glykosylierung. Das raue ER ist eine Hilfskomponente von das breitere endoplasmatische Retikulum, das neben den rauen Kanten des ER eine glatte Oberfläche enthält. Trotz der gemeinsamen Nutzung eines Standorts führen die glatten und rauen ER verschiedene Funktionen aus, um grundlegende Operationen innerhalb von Zellen zu erleichtern.
Der Unterschied zwischen dem rauen ER und dem glatten ER beginnt auf der Oberflächenebene. Die Oberfläche des rauen ER ist mit Ribosomen zur Proteinherstellung übersät, die ihm ein gespicktes und ungleichmäßiges Aussehen verleihen. Nach Angaben der Georgia State University wird das raue ER durch das Vorhandensein von Ribosomen identifiziert, da das glatte ER diese Zellbestandteile nicht anzieht oder zurückhält. Das raue ER enthält eine Schlüsselbindungsstelle, genannt Translokon, die Ribosomen anzieht und einfängt. Ribosomen heften sich nur für kurze Zeit an die ER-Oberfläche; sie bleiben jedoch lange genug, um die Bildung einer Protein-Nukleinsäure abzuschließen. Raue ERs dienen nicht nur als Behausung für Ribosomen, sondern produzieren auch mehrere Enzyme und Proteine, die dann in die umgebende Zelle sezerniert werden. Raue ERs erzeugen auch schützende Taschen, die Protein zum Golgi-Komplex transportieren.
