Magenlipase ist ein Protein, das Fett im Magen verdaut. Zusammen mit dem Protein Linguallipase macht die Magenlipase 30 Prozent der Fettverdauung bei Erwachsenen und bis zu 50 Prozent der Fettverdauung bei Säuglingen aus .
Magenlipase und Linguallipase werden zusammenfassend als saure Lipasen bezeichnet. Diese Proteine unterscheiden sich von anderen Fettverdauungsmechanismen, da sie für ihre Funktion keine Galle benötigen. Dies ermöglicht eine gewisse Fettverdauung bei Personen mit eingeschränkter Pankreasfunktion.
Magen- und Linguallipasen wirken beide hauptsächlich im Magen. Bei Patienten mit Mukoviszidose und Pankreaserkrankungen funktionieren diese Proteine weiterhin im Dünndarm. Dies ist auf das Fehlen der normalerweise im Dünndarm vorhandenen alkalischen Lipasen zurückzuführen.