Männliche Leguane haben große Kiefermuskeln, die wie Backen aussehen, und zwei Fettablagerungen auf der Stirn, wodurch die Köpfe der männlichen Leguane größer und blockiger werden als die der Weibchen. Ein Männchen hat auch einen größeren, schwereren Körper und eine Ausbuchtung in der Nähe des Schwanzansatzes, wo sich seine Fortpflanzungsorgane befinden.
Männliche Leguane haben auch sehr auffällige Femurporen an ihren Innenseiten der Oberschenkel. Es dauert 18 bis 24 Monate, bis ein Leguan reif genug ist, um festzustellen, ob es sich um ein Männchen oder Weibchen handelt. Sobald der Leguan eine Länge von 6 bis 10 Zoll von der Schnauze bis zur Öffnung erreicht hat, treten sekundäre Geschlechtsmerkmale auf.