Das Molekulargewicht von Myoglobin hängt davon ab, welches Myoglobin des Organismus verwendet wird. Für die Kalibrierung in der Massenspektrometrie werden Pferdemyoglobin und Pottwalmyoglobin am häufigsten verwendet. Pferdemyoglobin hat ein Molekulargewicht von 16.951,49 und das Myoglobin von Pottwalen hat ein Molekulargewicht von 17.199,91.
Myoglobin ist ein kleines, rotes Protein, das in Muskeln vorkommt. Es bindet Sauerstoffmoleküle und liefert sie, wenn der Muskel arbeitet. Die rote Farbe von Fleisch ist hauptsächlich auf Myoglobin-Proteine zurückzuführen. Wassersäugetiere, die über längere Zeit tauchen, wie Delfine oder Pottwale, haben mehr Myoglobin als andere Säugetiere. Dies gibt ihnen einen zusätzlichen Sauerstoffvorrat, sodass sie seltener Luft holen können.