Codon Usage Bias ist die Tendenz einiger Organismen, beim Aufbau von Aminosäuren bestimmte DNA-Tripletts gegenüber anderen, gleichermaßen leistungsfähigen Tripletts zu verwenden. Viele der 20 Aminosäuren, die das Leben benötigt, können aufgebaut werden durch unterschiedliche DNA-Sequenzen; Es ist nicht klar, warum einige Sequenzen bevorzugt werden.
Jede der 61 aus drei Buchstaben bestehenden DNA-Sequenzen, die als Tripletts bekannt sind, kann für die Produktion einer Aminosäure kodieren. Da nur 20 Aminosäuren vom Leben verbraucht werden, können einige auf verschiedenen Wegen aufgebaut werden. Viele Organismen, wie beispielsweise Bäckerhefe, zeigen eine deutliche Präferenz für die Verwendung einiger Tripletts oder Codons zum Aufbau von Aminosäuren gegenüber anderen. Diese Voreingenommenheit wird häufiger gezeigt, als der Zufall es vorhersagen würde.