Der Kojote frisst Pelikane, ebenso wie Katzen und Menschen. Kleinere Säugetiere und Vögel wie Stinktiere, Möwen und Wildkatzen jagen nach jungen Pelikanen. Menschen sind auch Raubtiere des Pelikans, jagen sie wegen ihrer Federn und essen das Fleisch.
Pelikane sind große Vögel, was sie für die meisten Raubtiere in ihrer natürlichen Umgebung zu einer schwereren Beute macht. Aus diesem Grund jagen die meisten Tiere sie nicht. Ein verletzter Pelikan, der nicht fliegen kann, ist jedoch eine leichte Beute für Wildhunde, Wildkatzen und größere Säugetiere.
Neben der Pelikanjagd hat der Mensch auch mit Pestiziden wie DDT den Rückgang der Pelikanpopulation verursacht. Diese Pestizide führen dazu, dass die Eier von Pelikanen unfruchtbar bleiben oder beschädigte Küken schlüpfen. Einige Pelikanarten sind in Nordamerika noch immer vom Aussterben bedroht.
