Einige gemeinsame Merkmale von Prokaryoten und Eukaryoten sind, dass sie Zellplasmamembranen, Zytoplasma, DNA und Ribosomen aufweisen. Zu Prokaryoten gehören Organismen wie Bakterien und Cynobakterien, während Algen, Pilze und Protozoen Arten von Eukaryoten sind. Obwohl diese verschiedenen Arten von Organismen gewisse Ähnlichkeiten aufweisen, gibt es noch viele weitere Unterschiede.
Ein Hauptunterschied besteht darin, dass Eukaryoten einen Kern haben, während Prokaryoten keinen besitzen. Im Gegensatz zu Eukaryonten haben prokaryontische Organismen keine membrangebundenen Organellen innerhalb der Zelle. Eukaryontische Zellen sind viel größer als prokaryontische Zellen. Zum Beispiel kann die Größe prokaryotischer Zellen zwischen 2 und 20 Mikrometer liegen, während die Größe eukaryotischer Zellen zwischen 10 und 100 Mikrometer im Durchmesser liegt. In Bezug auf die Zellteilung teilen sich prokaryontische Zellen durch binäre Spaltung und eukaryontische Zellen durch den Prozess der Mitose.