Pflanzenzellen einer Zwiebelzwiebel haben keine Chloroplasten, da dieser Teil der Pflanze unter der Erde wächst, wodurch er das für die Photosynthese erforderliche Licht nicht absorbieren kann. Die meisten unterirdischen Wurzel- und Zwiebelstrukturen in Pflanzen haben kein Chloroplasten aus diesem Grund.
Obwohl Zellen ganz oben in der Zwiebel, die durch den Boden spähen, Chloroplasten entwickeln können, besteht die Hauptfunktion dieser Zellen darin, die Pflanze vor schädlichen Krankheitserregern im Boden zu schützen und Energie zu speichern. Diese Funktionen werden durch die Zellwand, Zellmembran, Zytoplasma, Zellkern und das große Vakuum der Zelle ermöglicht.
Lichtmikroskopie macht den Kern einer Zwiebelzelle am Rand des Zytoplasmas sichtbar. Die Vakuole ist in der Mitte der Zelle sichtbar. Diese Vakuole ist in den Zellen weißer Zwiebeln transparent, so dass sie für das Lichtmikroskop unsichtbar sind, es sei denn, sie werden gefärbt. Zellen von roten Zwiebeln sind von Natur aus pigmentiert und erfordern keine Zugabe eines Färbemittels.
Die besten Proben für die Betrachtung durch ein Lichtmikroskop werden aus dünnen Scheiben kleiner, fester Zwiebeln hergestellt. Die Orientierung der Zellen unter einem Lichtmikroskop kann ihre Sichtbarkeit erhöhen oder verringern. Je mehr Licht durchgelassen wird, desto besser wird die Auflösung.
