Die Kladistik veranschaulicht die sich ständig weiterentwickelnden evolutionären Beziehungen zwischen Lebensformen, während das Linnaean-System Organismen nach festen physikalischen Merkmalen klassifiziert. Die Kladistik organisiert alles Leben im Rahmen der Evolutionstheorie, während das Linnaean-System die zurück zu einem aristotelischen Konzept wissenschaftlicher Namen.
Kladistik ist eine Methode, die entwickelt wurde, um das evolutionäre Modell mit der praktischen Notwendigkeit der Klassifizierung von Organismen zu verbinden. Cladistics zeigt Evolutionszweige und ermöglicht es Benutzern, zu jedem Zeitpunkt ihrer Evolutionsgeschichte zu sehen, wie eng eine Art mit einer anderen Art verwandt ist. Die Kladistik organisiert das Leben nach der Entwicklungsgeschichte und nicht nach der Ähnlichkeit einer Lebensform mit einer anderen zu einem bestimmten Zeitpunkt. Cladistics ist nicht für die Verwendung außerhalb der Evolutionstheorie gedacht.
Carl Linnaeus entwickelte sein System in dem Versuch, jeder unterschiedlichen Lebensform einen universellen Namen und einen Platz innerhalb einer Struktur allen Lebens entsprechend physischer Ähnlichkeiten zu geben. Diese Struktur bezeichnet eine Art, Gattung, Familie, Ordnung, Klasse und Königreich für jeden Organismus. Linné stützte sich auf ein früheres Klassifikationsmodell von Aristoteles, obwohl Linné das Modell von Aristoteles änderte und erweiterte. Das Linné-System gruppiert Arten mit physischen Ähnlichkeiten, unabhängig davon, wie diese Merkmale bei jeder Art entwickelt wurden.