Einige Echsenarten, darunter der Bartagamen, der Uromastyx und der Blauzungenskink, sind Allesfresser. Die meisten anderen Arten sind reine Insekten-, Fleisch- oder Pflanzenfresser.
Die meisten Eidechsenarten haben je nach Umgebung eine spezielle Ernährungsweise angepasst. Die meisten Eidechsen ernähren sich hauptsächlich von Insekten, Spinnen und anderen kleinen Wirbellosen. Bestimmte größere Arten, wie Warane und Komodowarane, sind Fleischfresser und fressen tote Tiere und lebende Beute, die sie jagen und sich selbst töten. Leguane hingegen sind strenge Pflanzenfresser und fressen nur Pflanzen. Andere beliebte Haustierarten wie Geckos genießen Insekten und frische Produkte in Gefangenschaft.