Sie können einen Mikroorganismus ohne ein Mikroskop nicht sehen. Sie können auch Mikroorganismen wie Bakterien in kontaminierten Lebensmitteln nicht schmecken oder riechen. Sie können jedoch den Geruch von Bakterien riechen, die Schweiß verstoffwechseln. Pilzinfektionen der Zehennägel erzeugen auch einen Geruch.
Während alle Bakterien und Archaeen Mikroorganismen sind, sind es nur einige Pilze und Algen. Einige Tiere, wie Rädertierchen und fast alle Protozoen, sind mikroskopisch klein. Die winzigen Organismen leben im Boden, in der Atmosphäre, auf dem Meeresboden und tief im Gestein. Mikroorganismen unterstützen die Zersetzung beim Recycling von Nährstoffen in Ökosystemen. Mikroorganismen in der Luft können Niederschlag und Wetter beeinflussen. Andere sind im Stickstoffkreislauf aktiv.
