Obwohl es keinen einzigen Erfinder des Mikroskops gibt, erfanden Zacharias Janssen und sein Vater Hans 1595 das erste zusammengesetzte Mikroskop. Beide Brillenhersteller bewiesen mit ihrer Erfindung, dass eine Reihe von Linsen im Inneren eine Tube erzeugt ein vergrößertes Bild.
Das Mikroskop von Janssens war handgehalten und bestand aus bikonvexen und plankonvexen Linsen, die Bilder bis zum 10-fachen ihrer tatsächlichen Größe vergrößern konnten. In den 1600er Jahren entwickelte Anton van Leeuwenhoek ein einfaches Mikroskop mit einem stärkeren Fokus und einer stärkeren Vergrößerung, um Mikroorganismen und Zellen zu betrachten. Das zusammengesetzte Mikroskop von Robert Hooke verwendete Beleuchtung, um Pflanzen- und Tierzellen, Mineralien und Fossilien zu beobachten. In den 1800er Jahren untersuchten Carl Zeiss, Otto Schott und Ernst Abbe die Vergrößerung weiter und verbesserten die Farbgenauigkeit und das Glas. 1931 erfand Ernst Ruska die erste Elektronenlinse.