Protozoen leben in Meeren, Flüssen, Seen, Teichen, verrottenden Materialien und im Boden. Wasser ist eine Voraussetzung für ihren Lebensraum und sie können in verschiedenen Regionen existieren, in denen dies vorhanden ist.
Protozoen, die in Salzwasser leben, benötigen keine Vakuolen, die Strukturen im Zytoplasma sind, die bei der intrazellulären Sekretion wirken. Die Salzkonzentration in der Zelle ist ähnlich der Konzentration im Meerwasser und es besteht keine Notwendigkeit, Flüssigkeiten zusammenzuziehen und zu entleeren. Protozoen, die diese Strukturen besitzen und unter weniger salzigen Bedingungen leben, entleeren Wasser durch eine Pore in der Membran und überschüssige Flüssigkeit gelangt in die Zelle.
