Die meisten Pilze haben keine negativen Auswirkungen auf den Menschen, obwohl einige Arten Krankheiten verursachen können. Ein Beispiel dafür ist Schimmel in Innenräumen, der laut Universität Atemwegserkrankungen verursachen und verschlimmern kann von Minnesota.
Obwohl die meisten Pilze dem Menschen keinen Schaden zufügen, können solche, die dies tun, schwerwiegende Auswirkungen haben. Wenn beispielsweise opportunistische Pilze aus dem Boden in die Wunde einer Person mit geschwächtem Immunsystem, wie beispielsweise eines Diabetespatienten, eindringen, kann dies eine aggressive Infektion verursachen. Die meisten Infektionen, die Pilze verursachen, sind oberflächlich, das heißt, sie treten über die Haut oder das Haar auf. Beispiele hierfür sind Fußpilz und Ringelflechte.
Wenn Pilze als Infektion in den Körper gelangen, können sie tödliche systemische Reaktionen hervorrufen. Menschen, die in Haushalten leben, in denen Schimmelpilze vorhanden sind, sind gefährdet, oberflächliche und innere Infektionen zu entwickeln. Die Art der Infektion, auf die sie stoßen, und wie schwer sie ist, hängt von der Art des Pilzes und seiner Giftigkeit ab. Zum Beispiel sind Personen, die Grünschimmel einatmen, einem höheren Risiko ausgesetzt als Personen, die andere Arten einatmen. Zu den Gesundheitsproblemen, die durch das Einatmen von Schimmelpilzen entstehen, gehören allergische Reaktionen, Sinusitis als Folge einer Allergenexposition, Pneumonitis und allergisches Asthma.