Die Diffusionsraten hängen von der Molekülgröße ab, da größere Moleküle langsamer diffundieren als kleinere Moleküle. Die Größen der an der Diffusion beteiligten Partikel sind wichtig, da sie eng mit den Konzepten von Wärme und Energie in der Kontext der Verbreitung. Es braucht mehr Energie und Wärme, um ein größeres Objekt zu bewegen als ein kleineres, daher benötigen größere Partikel mehr Wärme von ihrer Umgebung.
Diffusion hängt stark von Energie und Bewegung ab. In jeder gegebenen Umgebung gibt es mehrere Faktoren, die die Mobilität eines Moleküls beeinflussen: Größe des Moleküls, Viskosität der Umgebung, Wechselwirkungen zwischen Makromolekülen und die spezifische Transportart, die das Molekül verwendet. Da die Diffusion von der Bewegung abhängt und die Bewegung von der Größe des Moleküls abhängt, besteht eine direkte Beziehung zwischen der Molekülgröße und der Diffusionsrate.
Größere Moleküle benötigen größere Energiemengen, um die gleiche Aktivität wie kleinere Moleküle auszuüben. Wenn die Energie nicht ausreicht, um ein größeres Molekül zu bewegen, widersteht es den Effekten der Diffusion und kann sich nicht von einem Bereich zum nächsten bewegen. Eine Zunahme der Umgebungswärme oder andere äußere Faktoren haben auch einen Einfluss auf die Energie, die beim Diffusionsprozess beteiligt ist, und die Geschwindigkeit, mit der ein großes Molekül diffundiert.