Die drei Arten von Archaebakterien verwenden jeweils eine andere Art von Methode zur Herstellung von ATP, darunter die Umwandlung von Methan in ATP durch die Methanogene, die Verwendung von aerober Atmung oder die Umwandlung von Lichtenergie durch die Halophile und Theromophile, die Schwefelwasserstoff umwandeln um ATP zu erzeugen. Diese Bakterienarten werden aufgrund der Bedingungen, in denen sie häufig leben, in einer eigenen Klasse gehalten. Die Archaebakterien sind die ältesten bekannten lebenden Organismen der Welt.
Methanogene sind insofern einzigartig, als sie in sauerstoffreichen Umgebungen nicht existieren können. Diese Bakterien kommen vor allem in Bereichen wie Mooren, Abwasser und sogar im Darm vor. Gewöhnliche Bakterien können in Gebieten mit hohem Salzgehalt nicht überleben, aber in der Klassifizierung der Archaebakterien gibt es eine Ausnahme. Halophile gedeihen in salzreichen Umgebungen wie dem Toten Meer oder den Großen Salzseen. Halophile können im Gegensatz zu den anderen Archae-Arten mit einem Pigment namens Bakteriorhodopsin den von ihnen verwendeten Energieerzeugungsprozess von der aeroben Atmung auf die Photosynthese umstellen. Thermophile leben in Gebieten mit hohem Säuregehalt und hoher Hitze. Sie können Temperaturen von bis zu 230 Grad Fahrenheit überleben, was vulkanische Schlote und hydrothermale Schlote zu idealen Gebieten für ihr Gedeihen macht. Ihre Formen können einem pH-Wert von bis zu 2 standhalten. Diese Bakterienarten werden trotz ihrer Einzigartigkeit als Prokryate klassifiziert.
