Kupfer bildet sich als geschmolzenes Gestein mit kleinen Mengen Kupfer, das kristallisiert. Wenn das größere Gestein weiter erstarrt, wandert das kupferreiche Fluid in Risse und verfestigt sich schließlich ebenfalls. Da das Kupfer später als andere Mineralien im größeren Gestein erstarrt, weisen die endgültigen Lagerstätten eine hohe Konzentration auf.
Kupfer kommt am häufigsten in Lagerstätten vor, in denen auch Blei, Silber, Gold und Zink vorhanden sind. Porphyr-Kupferlagerstätten enthalten die bedeutendsten Kupferfunde; Porphyr-Ablagerungen begannen als große Konzentrationen von geschmolzenem Gestein, das langsam abkühlte und in der Erdkruste kristallisierte. Während des Abkühlprozesses entwickelten sich große Kristalle, um die sich kleinere bildeten; die kleineren sind Porphyre.
Anfangs ist die Kupfermenge im geschmolzenen Gestein ziemlich gering. Beim Abkühlen der Gesteinsschmelze verfestigen sich zuerst die anderen Mineralien, so dass die Konzentration des in der Flüssigkeit verbliebenen Kupfers ansteigt. Der Kristallisationsprozess lässt das Gestein schrumpfen und bildet Risse, und die verbleibende Flüssigkeit wandert in diese Risse. Zu diesem Zeitpunkt enthält die Flüssigkeit sehr viel Kupfer, so dass es bis zum Erstarren fast reines Kupfer ist. Die Lagerstätten treten auf, wenn das darüber liegende Gestein erodiert und das Kupfer dem Bergbau ausgesetzt wird.